Corresponde al Estado la regulación y promoción de la investigación arqueológica en el Perú, es decir de interés social y científico, a través del Ministerio de Cultura. Es objeto de la investigación arqueológica, el estudio de los restos materiales y el contexto cultural y ambiental de las sociedades que existieron en el territorio nacional, así como su protección, conservación y difusión. Las investigaciones arqueológicas comprenden tres modalidades:
- Proyectos de investigación arqueológica, originados por interés científico.
- Proyectos de evaluación arqueológica, originados por la afectación de obras públicas, privadas o causas naturales.
- Proyectos de emergencia, originados por acción humana o natural imprevista.

Los proyectos de investigación arqueológica son:
- Proyectos de investigación arqueológica sin excavaciones: es el reconocimiento sistemático de superficie, terrestre o subacuático con o sin recolección de material arqueológico que permiten ubicar, registrar y caracterizar los sitios arqueológicos sin que ello implique remoción de terreno o inmueble alguno.
- Proyectos de investigación arqueológica con excavaciones: referido a las investigaciones con intervención física del sitio o monumento arqueológico e histórico inmueble, con remoción de terreno y elementos asociados, destinados al estudio detallado de las evidencias tangibles con fines científicos. En este rubro se consideran los proyectos de prospección con excavaciones, los cuales deberán ser debidamente sustentados.
- Programas de investigación arqueológica referidos a las investigaciones integrales y multidisciplinarias que involucren un valle o una región determinada y/o representen investigaciones programadas para largo plazo.
- Proyectos (con o sin excavaciones) con fines de consolidación, conservación y mantenimiento, y puesta en valor de bienes inmuebles arqueológicos y su entorno cultural y natural (con o sin excavaciones).
- Proyectos de estudios sobre fondos museográficos, de colecciones arqueológicas en general.